Saltatu nabigazio-menua eta joan edukira

EROSKI CONSUMER, kontsumitzailearen egunkaria

Bilatzailea

Fundazioaren logotipoa

EROSKI CONSUMERen kanalak


Artikulu hau itzulpen automatikoko sistema batek itzuli du. Informazio gehiago, hemen.

Euskarara itzultzeko sistemek aurrerapen handiak izan dituzte azken urteotan, baina oraindik badute zer hobetua. Hobekuntza horren parte izan nahi? Aukeratu esaldi osoak nahieran, eta klikatu hemen.

Genomatik metagenomara

Gure organismoko bakterioen kode genetikoak deszifratzeak gako berriak ekarriko lituzke obesitatea bezalako gaixotasunak ezagutzeko

  • Egilea: Egilea

  • arabera: Igandea, 2008ko uztailaren 27a
Img floraintestinal Irudia: NIAID

Giza Genomaren sekuentziazioak, 2003ko apirilean osatuak, beste proiektu bat ireki du, are asmo handiagokoa: metagenomaren sekuentziazioa, hau da, giza gorputzean dauden mikroorganismoen gene guztiak. Bakterio horietako gehienak (%90 eta %95 artean) digestio-traktuan daude eta gainerakoa (%5) azalean eta mukosetan. Komunitate zientifikoaren helburuetako bat bere funtzioak azaltzea da.

Metagenoma eta mikrobioma

/imgs/2008/07/laboratorio1.jpg

Gizabanako bakoitzak bere zelulak baino 10 aldiz bakterio gehiago ditu -zelula horiek, aldi berean, gizabanakoak gurasoengandik jaso dituen gene guztiak dituztenak-; beraz, pertsona bizi batek 10 bilioi zelula ditu, eta horiekin 100 bilioi mikroorganismo bizi dira -izaki bizidun elkartuak dira eta beren geneak dituzte. "Metagenoma gurekin modu intimoan bizi diren bakterioen geneak dira", azaldu du Francisco Guarnerrek, Bartzelonako Vall dHebron Unibertsitate Ospitaleko Digestio Aparatuaren Zerbitzuko atalburuak.

Mikrobioma metagenomaz hitz egiteko beste modu bat da. "Mikrobioma gizakiarekin bizi diren mikrobioen gene-multzoa da; metagenoma, berriz, gizakiarentzat lan egiten duten geneak dira, baina ez dira giza geneak", erantsi du Guarnerrek. Egia esan, bi kontzeptuak sinonimotzat erabil daitezke, baina bien artean ñabardura semantiko txiki bat.

Komunitate zientifikoaren zalantza nagusia bakterio horiek gure organismoan zertan ari diren jakitea da.Animalia ugaztunekin (arratoiak edo arratoiak) egindako esperimentuetan ikusi da indibiduo batzuk bakteriorik gabe bizitzeko gai direla. Animalia horiek egoera antzuan jaiotzen dira, zesarea bidez; eremu antzu batean bizi dira eta janari esterila jasotzen dute, bakterioekin kontakturik ez izateko. Esperimentu horiei esker, bakarrik -bakteriorik gabe- bizi diren animaliak txikiagoak direla egiaztatu da, janari gehiago kontsumitu behar badute ere (gutxiago aprobetxatzen dute jaten dutena). Baina, batez ere, deigarria da sistema immunea ez dutela hainbeste garatzen, eta, beraz, linfozito gutxi eta immunoglobulina-maila apalak dituzte.

Emaitza horiei esker ulertu ahal izan da bakterioak gizakiarekin bizi direla "modu eskuzabalean; badakigu gorputzaren garapenean parte hartzen dutela, janari gutxiago aprobetxatzen dugula eta sistema immunean eragiten dutela", dio Guarnerrek. Baina, ezagutza orokor horiek gorabehera, ez da erraza zehaztea zer egiten duen gene eta bakterio bakoitzak.

Zer bilatzen dute zientzialariek?

Organismoko 100 bilioi bakterio horietatik gene bakoitzak zehazki zer egiten duen jakitea da zientzialarien helburua. Gaur egun, gizakiarekin bizi diren bakterioen %60tik %80ra bitarte ez dira ezagutzen "izen-deiturak". Ezjakintasun horren arrazoia da ezin direla laboratu eta erreproduzitu laborategian aztertzeko. Gaur egungo interes zientifikoa ez da bakterio horien errolda egitea, baizik eta gure organismoan zer egiten ari diren jakitea. Hori da argitu nahi den zalantza nagusia.

Horregatik, ikerketen planteamendua geneak sekuentziatzea da, hau da, geneak osatzen dituzten aminoazidoen oinarriak zein ordenatan dauden jakitea, eta, sekuentziatu ondoren, datu-base zientifikoetan zein proteina dagokien bilatzea. Gene bakoitzak proteina bat kodetzen duenez eta proteina bakoitzak funtzio bat duenez, horixe da ikertzaileek gizakiarekin bizi diren bakterioen funtzioak zein diren jakiteko modua. Horretarako, lan bioinformatiko oso konplexua egin beharko da.

Mikrobiomaren proiektu horrek eskatuko duen sekuentziazio-esfortzua Giza Genoma proiektuarena baino handiagoa da. "Kasu horretan pentsatu zen 50.000 eta 100.000 gene artean egongo zirela, baina, azkenean, ikusi da 30.000 gene baino gutxiago dituela gizakiak. Baina, giza mikrobio guztien geneen kasuan, lau milioi egongo direla kalkulatzen da", dio Guarnerrek.

Giza Genoma proiektutik, metagenoma sekuentziatzeko eskura dagoen teknologiak hobekuntza nabarmenak izan ditu, eta askoz ere ekipo eta sistema ahaltsuagoak daude material genetikoaren sekuentziazio automatikoa egiteko.

Eduki honen barruko orrialdekatzea


Hau interesa dakizuke:

Infografiak | Argazkiak | Ikerketak