Saltatu nabigazio-menua eta joan edukira

EROSKI CONSUMER, kontsumitzailearen egunkaria

Bilatzailea

Fundazioaren logotipoa

EROSKI CONSUMERen kanalak


Artikulu hau itzulpen automatikoko sistema batek itzuli du. Informazio gehiago, hemen.

Euskarara itzultzeko sistemek aurrerapen handiak izan dituzte azken urteotan, baina oraindik badute zer hobetua. Hobekuntza horren parte izan nahi? Aukeratu esaldi osoak nahieran, eta klikatu hemen.

Peer Bork, Berlingo (Alemania) Max Delbrueck Medikuntza Molekularreko Zentroko espezialista

350.000 proteina baino gehiagoko multzoa gara, bakoitza funtzio berezi batekin

  • Egilea: Egilea
  • arabera: Asteartea, 2009ko apirilaren 21a

Irudia: CONSUMER EROSKI

Proteinen garrantzia ez da soilik nutrizioa, baizik eta nutrizio horiek eta haien karakterizazio genetikoak biologia sistemiko (sistema biology) izeneko zientziaren eremu berri bat inauguratu dute mende hasieran. Peer Bork Berlingo (Alemania) Max Delbrueck Medikuntza Molekularreko Zentroan arlo horretako ikerketen buru da; “Nature”, “Science” edo “Cell” aldizkarietan argitaratutako 350 artikulu zientifiko baino gehiago idatzi ditu, eta bere iraultza berezia gaixotasunak alderantziz interpretatzea da, ez sintometatik eta gure sistemetan gaizki dabilenetik abiatuta, baizik eta programazioak gertatutakoa.

Giza gorputza arkitektura-pieza gisa interpretatzen duzu…

Gure taldeak oso eredu sinplea egin du, organismoa funtzio bat betetzeko genetikoki diseinatutako sistema-multzo gisa interpretatzen laguntzen duena; SMART (simple modular architecture research tool) deitzen diogu, eta hainbat eremutako ikertzaileei aukera ematen die giza gorputzaren zatiak ezagutzeko, gene jakin batekin lotutako pieza funtzional gisa. 1998az geroztik ari gara proiektu horretan lanean, giza genomaren aurrerapenen argitan, eta guztira 350.000 proteina identifikatu ditugu, horietako bakoitzak bete beharreko funtzio batekin… Dagoena da, garena.

Gure gorputzetan gertatzen den guztia azal dezakete proteinek?

Neurri batean, baina ez guztiz. Gaixotasunak ez dira akats espezifikoen ondorio, erantzun sistemikoen ondorio baizik. Aldaketa horietan organo edo zelula mota askok parte hartzen dute. Ondoretasunezko gaixotasunei dagokienez, kausa-efektu erlazioa oso argia da, baina gainerako gaixotasunetan kausalitatea konplexuagoa da eta biologia sistemikoa prozesuetan zer molekulak parte hartzen duten argitzen saiatzen da. Hesteetako espasmoak edo migrainak eragiten dituen gaineszitazioan zuzenean parte hartzen duten zenbait proteina ezagutzen ditugu.

Organismoaren funtzionamendua ulertzeko “jarraibide ofizialen gida” da giza genoma?

Bihotz-gutxiegitasuna bezalako nahasteak proteina baten konfigurazio espazial hutsetik abiatzen diren proiektuen baitan daude.Genomaren sekuentziazioa tresna garrantzitsua da, baina gertatzen den guztia ez dago aurrez programatuta. Badakigu, adibidez, zahartzea ez dela denboraren joanari bakarrik egotz dakiokeen fenomenoa, baizik eta DNAk gobernatutako gure arkitektura proteikoaren aldaketei. Hain zuzen, zelulen bizitza eta heriotza askoz gehiago daude programazio genetikoaren mende, aldi baterako edo ingurune berezi baten mende baino.

Izutzen ari zara… Zer ondorio etiko ditu horrelako lan batek?

Giza gorputzaren sistema molekularrak zenbat eta gehiago aztertu, orduan eta konplexuagoa da nortzuk garen diskurtsoa. Noiztik eta noraino merezi dugu gizakitzat hartzea? Nire ustez, eztabaida ez da antolakuntzakoa bezain filosofikoa. Gure izaera fisikoa azken ondorioetaraino ikertzeko prest gaude? Hasteko, ikerketa horiek funts publikoekin finantzatzen direla bermatu beharko genuke, eta, zoritxarrez, sinesgaitza dirudien arren, zientziak baliabide gehiago bideratzen ditu ikerketa militarrera, nuklearrera edo astrofisikara biologia molekularrera baino.

Laborategi gehiago sortu behar dira?

Premiazkoena arlo teknologikoan jada adierazitako ideiak garatzea da. Robotika eta bioingeniaritza izango dira biosistematikaren oinarri nagusiak. Arazoa ez dago ezagutzaren identifikazioan (geneak, adierazpen genetikoa, elkarrekintza bitarrak, funtzionaltasun molekularra), baizik eta haren ustiapenean, ondo aztertuz aukerak eta horien ondorioak denbora eta espazio iraunkor batean. Informatikak gure eskura jartzen dituen erraztasunak etengabe probatuko ditugu.

Zer egiten die proteinei hain molekula bereziak?

Lehen uste genuen proteina bat konfigurazio partikularreko aminoazido-multzo bat zela, eta garrantzi handiagoa ematen genion aminoazido horien izaerari haren konfigurazioari baino. Gaur egun badakigu molekula horien egitura-aldaketak funtsezkoak direla haien funtzioa definitzeko. Polipeptidoak (aminoazidoak) alde batera uzten ditugu, eta arreta handiagoa jartzen diegu haien kateei, “aldaketa postanslazional” (PTM) deritzonari, eta molekularen propietateak, funtzioa eta molekula berrien ernetzea alda ditzaketen atomoen ezaugarriei.

Gaur egun, zertan ari da zure taldea lanean?

Gure Berlingo taldea metagenomaren sekuentziazioa ikertzen ari da (giza gorputzean dauden mikroorganismoen gene guztiak), bide metabolikoekin zerikusia duena: geneak proteinekin erlazionatuz, proteina-sareak zelulen metabolismoarekin eta fenotipoen eta ingurumen-ezaugarrien arteko interakzioarekin. Dirudienez, ikerketa horietako gehienak ez dira laborategi batean egiten, ordenagailu ahaltsu baten pantailaren aurrean baizik.

ZIENTZIA BERRI BAT?

Img ordenadores
Irudia: Javier Aroche

Biologia ez da inoiz aurkitu Peer Bork irakasleak menderatzen duen diziplina honetan bezain hurbil: biologia sistemikoa. Eredu kuantitatiboen diseinutik abiatuta, zinetika entzimatikoa azaltzeko, neurozientziek azken hamarkadetan aurrera egiteko erabili duten irudigintza konputadorizatutik eta zibernetikaren garapenetik abiatuta, giza gorputza azaltzeko ez da beharrezkoa gorpuen disekzioa, baizik eta softwarearen afinazio oso zehatza. Biologia sistemikoko lehen institutuak mende honen hasieran sortu ziren Tokion (Japonia) eta Seattlen (Washington, AEB). eta giza genoma, proteomika eta bioinformatika aztertu zituzten.

Masa-espektrografiaren laguntzarekin, ikertzaileek DNA serieak lotzen dituzte hiru dimentsioko molekula-konfigurazio jakin batzuekin, zelula-funtzio metaboliko jakin batekin edo RNAk eragindako mutazioekin. Jakintza oso kotizatua da (Espainian, unibertsitateek selektibitate-notarik onenak eskatzen dituzte diziplina biosistemikoetako karreretan sartzeko) eta, aldi berean, translazionala; gaixotasun immuneak, infekziosoak edo metabolikoak, baita eragin soziosanitario handiko nahasteak ere, hala nola bihotz-gutxiegitasuna, proteina baten konfigurazio espazial hutsetik abiatzen diren proiektuen mende daude.


Hau interesa dakizuke:

Infografiak | Argazkiak | Ikerketak