Artigo traducido por un sistema de tradución automática. Máis información aquí.

‘Data lake’ sanitario: que é e como pode mellorar a nosa saúde

Este proxecto utiliza o big data paira acelerar a investigación médica, previr e tratar enfermidades
Por Natalia L. Pevida 8 de Febreiro de 2022
datos data lake
Imagen: geralt

Nos últimos anos, a renovación dos modelos de xestión sanitaria converteuse nunha prioridade paira moitos países. Paira facelo, apostouse pola intelixencia artificial como una das ferramentas crave que axudará a optimizar a atención dos pacientes e a prevención de enfermidades. Pero non se trata dun cambio repentino da folla de ruta. Co aumento da esperanza de vida e os avances da ciencia médica, creáronse os chamados data lakes. A continuación contámosche que é un data lake sanitario e as súas aplicacións máis importantes.

Que é un ‘data lake’ sanitario?

Dátaos lakes son uns repositorios centralizados de datos en bruto –sen estruturar nin clasificar– que poden ser procesados con ferramentas de big data. O seu obxectivo é facilitar o fluxo de información, adecuando a maneira de clasificar variables clínicas e, en definitiva, mellorar a capacidade de previr, diagnosticar e tratar os problemas de saúde.

Cos Fondos de Recuperación Europeos, España afronta o reto de converter ao sistema sanitario nun ecosistema de coñecemento integrado paira facer visibles os mecanismos máis descoñecidos da saúde e a enfermidade.

Máis aló das historias clínicas

A automatización de multitude de procesos mediante a intelixencia artificial é una constante na actualidade. Dátaos lakes preséntanse como una solución paira almacenar enormes cantidades de información que non están estruturadas nin filtradas. Una vez gardados todos eses datos, o big data daralle un propósito concreto cando se consulta.

“Hoxe en día, a cantidade de información médica que se xera é moi abundante. Moita procede de hospitais (probas de radioloxía, laboratorios, tratamentos) e outra dos niveis asistenciais de Atención Primaria, como urxencias ou as receitas electrónicas. En medicamento é importante a contextualidad dos síntomas, por iso o reto está na homogeneización de toda esa información”, explica Antonio Urda, traumatólogo e vicepresidente de Hospitais en Savana, compañía tecnolóxica especializada en data lakes sanitarios.

A captación e a almacenaxe de información dá lugar a dous tipos de bases de datos:

  • una primeira, sen a información persoal dos pacientes, pero cuxo xestor si mantería a capacidade de identificar cada dato.
  • una segunda completamente anónima, é dicir, sen posibilidade de identificar aos pacientes que xeran devanditos datos.

Paira que serve un ‘data lake’ sanitario?

“Contar cunha base de datos na que se poida contactar con cada paciente é moi útil nos casos de alerta sanitaria, paira identificar á vez a todas as persoas que poderían estar afectadas sen necesidade de acudir a moitas fontes de información diferentes”, apunta o doutor Urda, quen cita como exemplo a detección de fallos en lotes de marcapasos, implantes ou próteses.

Tamén pode axudar paira recrutar pacientes paira ensaios clínicos. “Por exemplo, si hai un estudo aberto, pódese acudir a esta base de datos paira detectar a todos eses pacientes que esgotaron as súas distintas liñas de tratamento oncolóxico e poderían beneficiar desa nova liña de tratamento”, engade Urda.

Outro caso de como pode axudar un data lake sanitario achégao Sergio Cinza, director da Axencia de Investigación da Sociedade Española de Médicos de Atención Primaria (SEMERGEN). “Sabemos desde hai anos que os pacientes con psoriasis teñen máis risco cardiovascular que outros enfermos porque hai un mecanismo inflamatorio común detrás de ambas as patoloxías que se estudou moi pouco”, explica. Paira tentar entender esta relación, puxeron en marcha o estudo REPICA, que está a recrutar en Atención Primaria a 102 pacientes con psoriasis paira analizar factores de risco cardiovascular, tratamentos, si teñen ou non enfermidade cardíaca e o seu prognóstico paira seguilos durante cinco anos. “Dispor dunha plataforma de data lake permitiríanos aforrar este cinco anos de estudo e aumentar o volume de participantes a 2.000 paira conseguir una potencia estatística suficiente paira identificar o tipo de paciente con psoriasis que ten alto risco de desenvolver una enfermidade cardiovascular”, explica Sergio Cinza.

Paira os expertos, as conclusións do algoritmo permiten ir máis aló da estatística clásica, o que supón un avance paira os estudos sobre enfermidades raras, cuxa baixa prevalencia e dispersión dos pacientes dificultan as predicións e actuacións sobre a evolución das patoloxías.

datos data lakeImaxe: herbert11timtim

E se os datos son anónimos?

Contar cunha base de datos completamente anónima permitiría un cambio de paradigma nos estudos de investigación con grandes mostras de poboación. Deste xeito, poderíanse empregar diferentes variables da aprendizaxe automática paira anticipar no tempo con máis precisión os factores de risco que determinan moitas enfermidades.

Tamén serviría paira detectar en tempo real novas epidemias infecciosas e paira entender os seus procesos de transmisión e mellorar así a prevención.

Paira que se pode utilizar?

Segundo Savana, en resumo, estas son as aplicacións de dátaos lakes:

  • Estudos observacionales baseados na evidencia de casos reais. Pódese aplicar á investigación clínica de  fármacos, de produtos sanitarios ou de protocolos de abordaxe clínica ou terapéutica.
  • Recrutar pacientes paira ensaios clínicos. Os investigadores a cargo destes ensaios poden acceder á información de posibles pacientes de forma moi rápida.
  • Plataforma de visualización e análise de datos. Esta información estará dispoñible paira os centros e autoridades sanitarias, paira a xestión de recursos ou a toma de decisións.
  • Modelos predictivos. Paira a elección guiada de tratamentos (medicamento personalizado) ou paira anticipar a derivación a especialistas.
  • Novos modelos de xestión sanitaria. Facer seguimento da nova tecnoloxía sanitaria adquirida polos hospitais paira saber si é efectiva ou non.

De pacientes a persoas

A investigación baseada en data lakes significa un cambio de situación dos enfermos crónicos e permite novos tratamentos e oportunidades. Paira Pedro Carrascal, membro do Comité de Directores da Plataforma de Organizacións de Pacientes (POP): “Os datos son una oportunidade de facer visible o invisible. En enfermidades como a esclerose múltiple hai multitude de síntomas que non ven. Dátaos lakes e o manexo cada vez máis detallado da información permitiría ir máis aló das probas hospitalarias paira integrar datos que dan una visión onde se teñen en conta a calidade de vida ou os aspectos sociais ou vitais e que pon ao paciente no centro desde a súa condición de persoa única e irrepetible”.

Pero as asociacións de pacientes saben que a idea de compartir datos xera reticencias entre os usuarios de sistemas sanitarios. “Desde as asociacións podemos impulsar que o paciente comparta os seus datos e participe activamente na creación de data lakes a través da educación sanitaria para que vexan a utilidade destas plataformas”, engade Pedro Carrascal. Ademais, estas organizacións encargaríanse tamén de defender a elaboración dunha normativa paira a explotación de datos en saúde sen menoscabar o dereito á privacidade.