Tant si ha instal·lat l’estany abans de plantar definitivament els exemplars del seu jardí com si ha decidit incorporar-ho una vegada que ja té la vegetació perfectament assentada, ha d’escollir amb molt les plantes i arbres que situa al seu al voltant.
En general es recomana que els estanys s’emplacin lluny dels arbres, ja que les fulles que cauen a l’estany es descomponen alliberant uns gasos que, en grans dosis, són mortals per als peixos i altres animals. A més un estany ple de fulles dona una sensació d’estar poca cura, per la qual cosa és necessari retirar-les, tasca bastant ingrata que caldrà fer molt sovint al llarg de la tardor.
A part d’aquesta consideració general, hi ha arbres que poden resultar especialment perjudicials com el poden ser els sauces. Les arrels d’aquests desmais són veritablement forts i sens dubte poden danyar el revestiment de l’estany, produint en ell forats pels quals s’escaparà l’aigua..
També hi ha una família d’arbres i/o arbustos del gènere Prunus que és millor mantenir allunyada dels estanys o qualsevol element d’aigua. La raó està en què habitualment aquestes pruneres i cirerers alberguen uns insectes, els áfidos, que en climes càlids i secs ataquen als nenúfares.
Altres enemics dels elements que hi ha dins d’un estany són el Laburnum i el llorer, tots dos posseeixen un fullatge i unes llavors altament tòxics com per estar en contacte amb l’aigua d’un estany. Si ho fan probablement arribin a acabar amb tota la vida animal que aquest alberg en el seu interior.